Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLPPQ16740 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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