Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms