Protein–RNA interactions for Protein: Q12112

TY1B-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-NL1Q12112 AGE2YIL044C 897 nt5.65□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 UBP7YIL156W 3216 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 CHL1YPL008W 2586 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 LCB5YLR260W 2064 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 FAT1YBR041W 2010 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 CAT5YOR125C 702 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 MSB2YGR014W 3921 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 ROG3YFR022W 2202 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 STE23YLR389C 3084 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 YDR250CYDR250C 276 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 GLE2YER107C 1098 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 SFK1YKL051W 1062 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 COG5YNL051W 1212 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 RPS1BYML063W 768 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 DBF4YDR052C 2115 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 IMP4YNL075W 873 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 RDS1YCR106W 2499 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 CST6YIL036W 1764 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 SWH1YAR042W 3567 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 NBP2YDR162C 711 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 YPL025CYPL025C 558 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 RRN3YKL125W 1884 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 MDL1YLR188W 2088 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 HMG1YML075C 3165 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1B-NL1Q12112 OPT1YJL212C 2400 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 snR7-LsnR7-L 214 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 SLN1YIL147C 3663 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 TIM12YBR091C 330 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 UBP10YNL186W 2379 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 IMP2YMR035W 534 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 PHO84YML123C 1764 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 MTD1YKR080W 963 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 ISR1YPR106W 1332 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 HOS2YGL194C 1359 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 DIN7YDR263C 1293 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 RIB4YOL143C 510 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 NCR1YPL006W 3513 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 MTC4YBR255W 2085 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 SDO1YLR022C 753 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 STE13YOR219C 2796 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 TPS3YMR261C 3165 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 ECM8YBR076W 1065 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 NSI1YDR026C 1713 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 MOH1YBL049W 417 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 SIW14YNL032W 846 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1B-NL1Q12112 PAU10YDR542W 363 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 PAU11YGL261C 363 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 PAU13YHL046C 363 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 ELF1YKL160W 438 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 PAU4YLR461W 363 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 YMR114CYMR114C 1107 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 OSW1YOR255W 837 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 DRS1YLL008W 2259 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 SKP2YNL311C 2292 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 TEL2YGR099W 2067 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 TUP1YCR084C 2142 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 TOG1YER184C 2385 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 DBP10YDL031W 2988 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 Q0182Q0182 405 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 MDJ2YNL328C 441 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 HUT1YPL244C 1020 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 EHD3YDR036C 1503 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 YOR1YGR281W 4434 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 PHO90YJL198W 2646 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 YCR006CYCR006C 474 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 OLE1YGL055W 1533 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 YGR139WYGR139W 339 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 VHS3YOR054C 2025 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 SPT10YJL127C 1923 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 URA3YEL021W 804 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 CDC45YLR103C 1953 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 MYO5YMR109W 3660 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 RKM2YDR198C 1440 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 SRP72YPL210C 1923 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 MAD2YJL030W 591 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 GCD14YJL125C 1152 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 ECM4YKR076W 1113 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 RFC3YNL290W 1023 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 ADP1YCR011C 3150 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 TFC6YDR362C 2019 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 PHA2YNL316C 1005 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 OPY2YPR075C 1083 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 CRZ1YNL027W 2037 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 PMT6YGR199W 2280 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 RRN6YBL014C 2685 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 OPI6YDL096C 327 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 PIM1YBL022C 3402 nt5.46□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 MCM7YBR202W 2538 nt5.46□□□□□ -1.53
TY1B-NL1Q12112 YER076CYER076C 909 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1B-NL1Q12112 KAP114YGL241W 3015 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1B-NL1Q12112 PMT2YAL023C 2280 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1B-NL1Q12112 CPA1YOR303W 1236 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1B-NL1Q12112 ACE2YLR131C 2313 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1B-NL1Q12112 SIP5YMR140W 1470 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1B-NL1Q12112 FDH1YOR388C 1131 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1B-NL1Q12112 YPL041CYPL041C 624 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1B-NL1Q12112 IDS2YJL146W 1410 nt5.44□□□□□ -1.54
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