Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CPSF1Q10570 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
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