Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms