Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKD1P98161 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKD1P98161 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKD1P98161 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKD1P98161 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKD1P98161 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKD1P98161 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKD1P98161 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKD1P98161 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKD1P98161 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKD1P98161 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKD1P98161 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKD1P98161 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKD1P98161 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKD1P98161 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKD1P98161 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKD1P98161 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKD1P98161 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKD1P98161 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKD1P98161 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKD1P98161 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKD1P98161 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKD1P98161 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKD1P98161 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKD1P98161 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKD1P98161 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PKD1P98161 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PKD1P98161 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKD1P98161 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKD1P98161 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKD1P98161 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKD1P98161 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKD1P98161 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PKD1P98161 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PKD1P98161 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKD1P98161 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKD1P98161 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms