Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms