Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A4P43007 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms