Protein–RNA interactions for Protein: P38957

SHU2, Suppressor of hydroxyurea sensitivity protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHU2P38957 RDI1YDL135C 609 nt5.85□□□□□ -1.47
SHU2P38957 TLG1YDR468C 675 nt5.85□□□□□ -1.47
SHU2P38957 YER010CYER010C 705 nt5.85□□□□□ -1.47
SHU2P38957 MEI4YER044C-A 1227 nt5.85□□□□□ -1.47
SHU2P38957 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.85□□□□□ -1.47
SHU2P38957 PHB1YGR132C 864 nt5.85□□□□□ -1.47
SHU2P38957 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.85□□□□□ -1.47
SHU2P38957 BAT2YJR148W 1131 nt5.85□□□□□ -1.47
SHU2P38957 NHA1YLR138W 2958 nt5.85□□□□□ -1.47
SHU2P38957 CPR3YML078W 549 nt5.85□□□□□ -1.47
SHU2P38957 YMR295CYMR295C 594 nt5.85□□□□□ -1.47
SHU2P38957 YOL131WYOL131W 327 nt5.85□□□□□ -1.47
SHU2P38957 BUD21YOR078W 645 nt5.85□□□□□ -1.47
SHU2P38957 PNG1YPL096W 1092 nt5.85□□□□□ -1.47
SHU2P38957 PTK2YJR059W 2457 nt5.84□□□□□ -1.47
SHU2P38957 YNR066CYNR066C 1311 nt5.84□□□□□ -1.47
SHU2P38957 PET100YDR079W 336 nt5.84□□□□□ -1.47
SHU2P38957 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.84□□□□□ -1.47
SHU2P38957 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt5.84□□□□□ -1.47
SHU2P38957 LEU5YHR002W 1074 nt5.84□□□□□ -1.47
SHU2P38957 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.84□□□□□ -1.47
SHU2P38957 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.84□□□□□ -1.47
SHU2P38957 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.84□□□□□ -1.47
SHU2P38957 YIL028WYIL028W 399 nt5.84□□□□□ -1.47
SHU2P38957 YML018CYML018C 1182 nt5.84□□□□□ -1.47
SHU2P38957 HAP3YBL021C 435 nt5.84□□□□□ -1.47
SHU2P38957 YPL199CYPL199C 723 nt5.84□□□□□ -1.47
SHU2P38957 AMA1YGR225W 1782 nt5.84□□□□□ -1.47
SHU2P38957 BDP1YNL039W 1785 nt5.84□□□□□ -1.47
SHU2P38957 ATP1YBL099W 1638 nt5.84□□□□□ -1.47
SHU2P38957 DSF1YEL070W 1509 nt5.84□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YNR073CYNR073C 1509 nt5.84□□□□□ -1.48
SHU2P38957 GAS5YOL030W 1455 nt5.83□□□□□ -1.48
SHU2P38957 SUP45YBR143C 1314 nt5.83□□□□□ -1.48
SHU2P38957 RSM10YDR041W 612 nt5.83□□□□□ -1.48
SHU2P38957 NPY1YGL067W 1155 nt5.83□□□□□ -1.48
SHU2P38957 RPS2YGL123W 765 nt5.83□□□□□ -1.48
SHU2P38957 EFG1YGR271C-A 702 nt5.83□□□□□ -1.48
SHU2P38957 RPR2YIR015W 435 nt5.83□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YKL162CYKL162C 1209 nt5.83□□□□□ -1.48
SHU2P38957 COS9YKL219W 1224 nt5.83□□□□□ -1.48
SHU2P38957 STM1YLR150W 822 nt5.83□□□□□ -1.48
SHU2P38957 ATG38YLR211C 681 nt5.83□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YMR085WYMR085W 1299 nt5.83□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.83□□□□□ -1.48
SHU2P38957 snR11snR11 258 nt5.83□□□□□ -1.48
SHU2P38957 PDB1YBR221C 1101 nt5.83□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.83□□□□□ -1.48
SHU2P38957 ALT1YLR089C 1779 nt5.83□□□□□ -1.48
SHU2P38957 HXT15YDL245C 1704 nt5.82□□□□□ -1.48
SHU2P38957 HXT16YJR158W 1704 nt5.82□□□□□ -1.48
SHU2P38957 KEL1YHR158C 3495 nt5.82□□□□□ -1.48
SHU2P38957 RPL12AYEL054C 498 nt5.82□□□□□ -1.48
SHU2P38957 MRPL17YNL252C 846 nt5.82□□□□□ -1.48
SHU2P38957 PFA3YNL326C 1011 nt5.82□□□□□ -1.48
SHU2P38957 MDY2YOL111C 639 nt5.82□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YNG1YOR064C 660 nt5.82□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YPR147CYPR147C 915 nt5.82□□□□□ -1.48
SHU2P38957 ARR3YPR201W 1215 nt5.82□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt5.82□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YDR444WYDR444W 2064 nt5.82□□□□□ -1.48
SHU2P38957 DIA3YDL024C 1407 nt5.82□□□□□ -1.48
SHU2P38957 ACC1YNR016C 6702 nt5.81□□□□□ -1.48
SHU2P38957 NGR1YBR212W 2019 nt5.81□□□□□ -1.48
SHU2P38957 UBX2YML013W 1755 nt5.81□□□□□ -1.48
SHU2P38957 CIK1YMR198W 1785 nt5.81□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YDL057WYDL057W 987 nt5.81□□□□□ -1.48
SHU2P38957 DAS2YDR020C 699 nt5.81□□□□□ -1.48
SHU2P38957 RNA15YGL044C 891 nt5.81□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YGL204CYGL204C 306 nt5.81□□□□□ -1.48
SHU2P38957 SPO7YAL009W 780 nt5.81□□□□□ -1.48
SHU2P38957 RPS5YJR123W 678 nt5.81□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YOR238WYOR238W 912 nt5.81□□□□□ -1.48
SHU2P38957 SUR1YPL057C 1149 nt5.81□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YPL162CYPL162C 822 nt5.81□□□□□ -1.48
SHU2P38957 CUP9YPL177C 921 nt5.81□□□□□ -1.48
SHU2P38957 PCL8YPL219W 1479 nt5.81□□□□□ -1.48
SHU2P38957 ASA1YPR085C 1332 nt5.8□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YDR109CYDR109C 2148 nt5.8□□□□□ -1.48
SHU2P38957 AIR2YDL175C 1035 nt5.8□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YEL010WYEL010W 351 nt5.8□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.8□□□□□ -1.48
SHU2P38957 ISC10YER180C 804 nt5.8□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt5.8□□□□□ -1.48
SHU2P38957 EMC4YGL231C 573 nt5.8□□□□□ -1.48
SHU2P38957 DAM1YGR113W 1032 nt5.8□□□□□ -1.48
SHU2P38957 PEX18YHR160C 852 nt5.8□□□□□ -1.48
SHU2P38957 SWD2YKL018W 990 nt5.8□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YLR463CYLR463C 552 nt5.8□□□□□ -1.48
SHU2P38957 PFK27YOL136C 1194 nt5.8□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YCL007CYCL007C 393 nt5.8□□□□□ -1.48
SHU2P38957 WTM2YOR229W 1404 nt5.8□□□□□ -1.48
SHU2P38957 QDR3YBR043C 2070 nt5.79□□□□□ -1.48
SHU2P38957 MET3YJR010W 1536 nt5.79□□□□□ -1.48
SHU2P38957 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.79□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YJR061WYJR061W 2808 nt5.79□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YCR108CYCR108C 192 nt5.79□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YGL185CYGL185C 1140 nt5.79□□□□□ -1.48
SHU2P38957 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt5.79□□□□□ -1.48
SHU2P38957 HSP150YJL159W 1242 nt5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 51.4 ms