Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HOXA10P31260 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms