Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
KDM5AP29375 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms