Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms