Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPREP23469 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPREP23469 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPREP23469 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPREP23469 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPREP23469 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPREP23469 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPREP23469 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPREP23469 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPREP23469 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPREP23469 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPREP23469 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPREP23469 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPREP23469 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPREP23469 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPREP23469 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPREP23469 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPREP23469 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPREP23469 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPREP23469 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPREP23469 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPREP23469 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPREP23469 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPREP23469 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPREP23469 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPREP23469 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPREP23469 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPREP23469 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPREP23469 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPREP23469 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPREP23469 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPREP23469 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPREP23469 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPREP23469 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPREP23469 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPREP23469 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPREP23469 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPREP23469 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPREP23469 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPREP23469 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPREP23469 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPREP23469 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPREP23469 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPREP23469 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPREP23469 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPREP23469 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPREP23469 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPREP23469 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPREP23469 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPREP23469 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPREP23469 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPREP23469 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPREP23469 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPREP23469 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPREP23469 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPREP23469 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPREP23469 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPREP23469 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPREP23469 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPREP23469 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPREP23469 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPREP23469 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPREP23469 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPREP23469 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPREP23469 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPREP23469 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPREP23469 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPREP23469 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPREP23469 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPREP23469 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPREP23469 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPREP23469 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPREP23469 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPREP23469 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPREP23469 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPREP23469 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPREP23469 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPREP23469 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPREP23469 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPREP23469 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPREP23469 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPREP23469 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPREP23469 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPREP23469 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPREP23469 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPREP23469 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPREP23469 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPREP23469 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPREP23469 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPREP23469 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPREP23469 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPREP23469 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPREP23469 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPREP23469 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPREP23469 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPREP23469 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPREP23469 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPREP23469 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPREP23469 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPREP23469 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms