Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18528 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18528 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18528 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18528 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18528 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18528 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18528 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18528 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18528 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18528 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18528 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18528 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18528 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18528 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18528 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18528 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18528 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P18528 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18528 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18528 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18528 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18528 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18528 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18528 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18528 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18528 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18528 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18528 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18528 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18528 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18528 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18528 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18528 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18528 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18528 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18528 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18528 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18528 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18528 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18528 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18528 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18528 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18528 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18528 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18528 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18528 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18528 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18528 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18528 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18528 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18528 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18528 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P18528 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18528 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18528 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18528 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18528 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18528 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18528 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18528 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18528 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18528 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18528 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18528 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18528 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18528 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18528 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18528 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18528 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18528 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18528 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18528 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18528 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18528 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18528 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18528 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18528 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18528 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18528 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18528 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18528 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18528 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18528 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18528 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18528 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18528 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18528 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18528 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18528 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18528 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18528 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18528 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18528 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18528 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18528 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18528 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18528 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18528 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18528 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms