Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFKMP08237 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFKMP08237 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFKMP08237 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFKMP08237 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFKMP08237 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PFKMP08237 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFKMP08237 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFKMP08237 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFKMP08237 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFKMP08237 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFKMP08237 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFKMP08237 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFKMP08237 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFKMP08237 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFKMP08237 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFKMP08237 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFKMP08237 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKMP08237 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKMP08237 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKMP08237 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKMP08237 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKMP08237 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKMP08237 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKMP08237 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKMP08237 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKMP08237 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKMP08237 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKMP08237 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKMP08237 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKMP08237 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKMP08237 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKMP08237 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKMP08237 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKMP08237 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PFKMP08237 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PFKMP08237 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFKMP08237 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFKMP08237 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PFKMP08237 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFKMP08237 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFKMP08237 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFKMP08237 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFKMP08237 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFKMP08237 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFKMP08237 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFKMP08237 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFKMP08237 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFKMP08237 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PFKMP08237 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFKMP08237 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFKMP08237 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFKMP08237 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFKMP08237 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFKMP08237 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFKMP08237 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFKMP08237 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFKMP08237 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKMP08237 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKMP08237 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKMP08237 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKMP08237 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKMP08237 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKMP08237 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKMP08237 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKMP08237 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKMP08237 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKMP08237 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKMP08237 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKMP08237 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKMP08237 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKMP08237 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKMP08237 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKMP08237 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKMP08237 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKMP08237 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKMP08237 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKMP08237 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKMP08237 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKMP08237 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKMP08237 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKMP08237 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKMP08237 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKMP08237 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKMP08237 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKMP08237 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKMP08237 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKMP08237 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKMP08237 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKMP08237 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKMP08237 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKMP08237 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKMP08237 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKMP08237 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKMP08237 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKMP08237 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKMP08237 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKMP08237 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFKMP08237 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFKMP08237 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms