Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOP08100 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOP08100 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOP08100 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOP08100 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOP08100 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOP08100 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOP08100 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOP08100 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOP08100 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOP08100 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOP08100 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOP08100 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOP08100 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOP08100 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOP08100 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOP08100 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOP08100 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOP08100 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOP08100 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOP08100 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOP08100 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOP08100 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOP08100 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOP08100 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOP08100 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOP08100 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOP08100 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOP08100 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOP08100 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOP08100 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOP08100 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOP08100 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOP08100 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOP08100 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOP08100 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOP08100 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOP08100 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOP08100 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOP08100 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOP08100 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOP08100 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOP08100 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOP08100 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOP08100 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOP08100 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOP08100 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOP08100 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOP08100 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOP08100 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOP08100 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOP08100 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOP08100 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOP08100 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOP08100 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOP08100 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms