Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms