Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
POLR1AO95602 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
POLR1AO95602 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms