Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG13O75143 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG13O75143 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG13O75143 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG13O75143 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG13O75143 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG13O75143 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG13O75143 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG13O75143 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG13O75143 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG13O75143 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG13O75143 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG13O75143 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG13O75143 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG13O75143 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG13O75143 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG13O75143 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG13O75143 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG13O75143 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG13O75143 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG13O75143 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG13O75143 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG13O75143 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG13O75143 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG13O75143 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG13O75143 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG13O75143 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG13O75143 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG13O75143 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG13O75143 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG13O75143 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG13O75143 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG13O75143 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG13O75143 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG13O75143 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG13O75143 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG13O75143 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG13O75143 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG13O75143 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG13O75143 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG13O75143 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG13O75143 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG13O75143 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG13O75143 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG13O75143 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG13O75143 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG13O75143 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG13O75143 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG13O75143 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG13O75143 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG13O75143 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG13O75143 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG13O75143 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG13O75143 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG13O75143 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG13O75143 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG13O75143 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG13O75143 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG13O75143 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG13O75143 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG13O75143 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG13O75143 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG13O75143 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG13O75143 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG13O75143 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG13O75143 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG13O75143 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG13O75143 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG13O75143 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG13O75143 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG13O75143 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG13O75143 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG13O75143 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG13O75143 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG13O75143 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG13O75143 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG13O75143 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG13O75143 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG13O75143 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms