Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cnih1O35372 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih1O35372 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms