Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP73A6NFT4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms