Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6BA6NDN3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms