Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
XIRP2A4UGR9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms