Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP4

Serpinb6c, Serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb6cW4VSP4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Serpinb6cW4VSP4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Serpinb6cW4VSP4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Serpinb6cW4VSP4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Serpinb6cW4VSP4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Serpinb6cW4VSP4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Serpinb6cW4VSP4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Serpinb6cW4VSP4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Serpinb6cW4VSP4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Serpinb6cW4VSP4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Serpinb6cW4VSP4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Serpinb6cW4VSP4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Serpinb6cW4VSP4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Serpinb6cW4VSP4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Serpinb6cW4VSP4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Serpinb6cW4VSP4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Serpinb6cW4VSP4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Serpinb6cW4VSP4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Serpinb6cW4VSP4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Serpinb6cW4VSP4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Serpinb6cW4VSP4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Serpinb6cW4VSP4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Serpinb6cW4VSP4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Serpinb6cW4VSP4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Serpinb6cW4VSP4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Serpinb6cW4VSP4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Serpinb6cW4VSP4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Serpinb6cW4VSP4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Serpinb6cW4VSP4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Serpinb6cW4VSP4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Serpinb6cW4VSP4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Serpinb6cW4VSP4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Serpinb6cW4VSP4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Serpinb6cW4VSP4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Serpinb6cW4VSP4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Serpinb6cW4VSP4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Serpinb6cW4VSP4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Serpinb6cW4VSP4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Serpinb6cW4VSP4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Serpinb6cW4VSP4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Serpinb6cW4VSP4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Serpinb6cW4VSP4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Serpinb6cW4VSP4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Serpinb6cW4VSP4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Serpinb6cW4VSP4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Serpinb6cW4VSP4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Serpinb6cW4VSP4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Serpinb6cW4VSP4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Serpinb6cW4VSP4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Serpinb6cW4VSP4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Serpinb6cW4VSP4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Serpinb6cW4VSP4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Serpinb6cW4VSP4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Serpinb6cW4VSP4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Serpinb6cW4VSP4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Serpinb6cW4VSP4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Serpinb6cW4VSP4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Serpinb6cW4VSP4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Serpinb6cW4VSP4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Serpinb6cW4VSP4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Serpinb6cW4VSP4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Serpinb6cW4VSP4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Serpinb6cW4VSP4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Serpinb6cW4VSP4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Serpinb6cW4VSP4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Serpinb6cW4VSP4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Serpinb6cW4VSP4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Serpinb6cW4VSP4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Serpinb6cW4VSP4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Serpinb6cW4VSP4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Serpinb6cW4VSP4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Serpinb6cW4VSP4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Serpinb6cW4VSP4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Serpinb6cW4VSP4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Serpinb6cW4VSP4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Serpinb6cW4VSP4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Serpinb6cW4VSP4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Serpinb6cW4VSP4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Serpinb6cW4VSP4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Serpinb6cW4VSP4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Serpinb6cW4VSP4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Serpinb6cW4VSP4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Serpinb6cW4VSP4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Serpinb6cW4VSP4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Serpinb6cW4VSP4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Serpinb6cW4VSP4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Serpinb6cW4VSP4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Serpinb6cW4VSP4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Serpinb6cW4VSP4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Serpinb6cW4VSP4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Serpinb6cW4VSP4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Serpinb6cW4VSP4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Serpinb6cW4VSP4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Serpinb6cW4VSP4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Serpinb6cW4VSP4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Serpinb6cW4VSP4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Serpinb6cW4VSP4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Serpinb6cW4VSP4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Serpinb6cW4VSP4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Serpinb6cW4VSP4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms