Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccne2Q9Z238 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccne2Q9Z238 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccne2Q9Z238 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccne2Q9Z238 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccne2Q9Z238 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccne2Q9Z238 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccne2Q9Z238 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccne2Q9Z238 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccne2Q9Z238 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ccne2Q9Z238 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ccne2Q9Z238 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ccne2Q9Z238 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccne2Q9Z238 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccne2Q9Z238 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccne2Q9Z238 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccne2Q9Z238 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ccne2Q9Z238 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ccne2Q9Z238 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccne2Q9Z238 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccne2Q9Z238 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccne2Q9Z238 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccne2Q9Z238 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccne2Q9Z238 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccne2Q9Z238 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ccne2Q9Z238 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccne2Q9Z238 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccne2Q9Z238 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccne2Q9Z238 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccne2Q9Z238 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccne2Q9Z238 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccne2Q9Z238 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccne2Q9Z238 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccne2Q9Z238 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccne2Q9Z238 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccne2Q9Z238 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccne2Q9Z238 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccne2Q9Z238 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccne2Q9Z238 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccne2Q9Z238 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Ccne2Q9Z238 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccne2Q9Z238 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccne2Q9Z238 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccne2Q9Z238 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ccne2Q9Z238 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccne2Q9Z238 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccne2Q9Z238 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccne2Q9Z238 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccne2Q9Z238 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccne2Q9Z238 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccne2Q9Z238 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccne2Q9Z238 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccne2Q9Z238 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccne2Q9Z238 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccne2Q9Z238 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccne2Q9Z238 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccne2Q9Z238 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccne2Q9Z238 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccne2Q9Z238 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccne2Q9Z238 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccne2Q9Z238 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccne2Q9Z238 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccne2Q9Z238 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccne2Q9Z238 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccne2Q9Z238 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccne2Q9Z238 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccne2Q9Z238 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccne2Q9Z238 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccne2Q9Z238 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccne2Q9Z238 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccne2Q9Z238 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Ccne2Q9Z238 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccne2Q9Z238 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccne2Q9Z238 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccne2Q9Z238 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccne2Q9Z238 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccne2Q9Z238 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccne2Q9Z238 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ccne2Q9Z238 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccne2Q9Z238 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccne2Q9Z238 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccne2Q9Z238 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccne2Q9Z238 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccne2Q9Z238 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccne2Q9Z238 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccne2Q9Z238 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccne2Q9Z238 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccne2Q9Z238 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccne2Q9Z238 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccne2Q9Z238 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccne2Q9Z238 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccne2Q9Z238 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccne2Q9Z238 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccne2Q9Z238 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccne2Q9Z238 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccne2Q9Z238 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccne2Q9Z238 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccne2Q9Z238 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccne2Q9Z238 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccne2Q9Z238 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms