Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfkbiaQ9Z1E3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfkbiaQ9Z1E3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfkbiaQ9Z1E3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NfkbiaQ9Z1E3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NfkbiaQ9Z1E3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfkbiaQ9Z1E3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfkbiaQ9Z1E3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NfkbiaQ9Z1E3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfkbiaQ9Z1E3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NfkbiaQ9Z1E3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NfkbiaQ9Z1E3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NfkbiaQ9Z1E3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NfkbiaQ9Z1E3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfkbiaQ9Z1E3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfkbiaQ9Z1E3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NfkbiaQ9Z1E3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NfkbiaQ9Z1E3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfkbiaQ9Z1E3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfkbiaQ9Z1E3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfkbiaQ9Z1E3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfkbiaQ9Z1E3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfkbiaQ9Z1E3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfkbiaQ9Z1E3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfkbiaQ9Z1E3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfkbiaQ9Z1E3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NfkbiaQ9Z1E3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfkbiaQ9Z1E3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfkbiaQ9Z1E3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfkbiaQ9Z1E3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfkbiaQ9Z1E3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfkbiaQ9Z1E3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfkbiaQ9Z1E3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfkbiaQ9Z1E3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfkbiaQ9Z1E3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfkbiaQ9Z1E3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NfkbiaQ9Z1E3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NfkbiaQ9Z1E3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfkbiaQ9Z1E3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfkbiaQ9Z1E3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbiaQ9Z1E3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbiaQ9Z1E3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbiaQ9Z1E3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfkbiaQ9Z1E3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfkbiaQ9Z1E3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfkbiaQ9Z1E3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfkbiaQ9Z1E3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfkbiaQ9Z1E3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NfkbiaQ9Z1E3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfkbiaQ9Z1E3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfkbiaQ9Z1E3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfkbiaQ9Z1E3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfkbiaQ9Z1E3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfkbiaQ9Z1E3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NfkbiaQ9Z1E3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfkbiaQ9Z1E3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfkbiaQ9Z1E3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfkbiaQ9Z1E3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfkbiaQ9Z1E3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfkbiaQ9Z1E3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfkbiaQ9Z1E3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfkbiaQ9Z1E3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbiaQ9Z1E3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NfkbiaQ9Z1E3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NfkbiaQ9Z1E3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NfkbiaQ9Z1E3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NfkbiaQ9Z1E3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NfkbiaQ9Z1E3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfkbiaQ9Z1E3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfkbiaQ9Z1E3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfkbiaQ9Z1E3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NfkbiaQ9Z1E3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfkbiaQ9Z1E3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfkbiaQ9Z1E3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbiaQ9Z1E3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbiaQ9Z1E3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbiaQ9Z1E3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbiaQ9Z1E3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfkbiaQ9Z1E3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms