Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cpne6Q9Z140 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cpne6Q9Z140 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpne6Q9Z140 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpne6Q9Z140 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpne6Q9Z140 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpne6Q9Z140 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cpne6Q9Z140 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cpne6Q9Z140 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpne6Q9Z140 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cpne6Q9Z140 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpne6Q9Z140 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpne6Q9Z140 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpne6Q9Z140 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpne6Q9Z140 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpne6Q9Z140 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpne6Q9Z140 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpne6Q9Z140 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpne6Q9Z140 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpne6Q9Z140 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpne6Q9Z140 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpne6Q9Z140 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpne6Q9Z140 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpne6Q9Z140 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpne6Q9Z140 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpne6Q9Z140 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpne6Q9Z140 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpne6Q9Z140 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpne6Q9Z140 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpne6Q9Z140 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cpne6Q9Z140 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpne6Q9Z140 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpne6Q9Z140 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpne6Q9Z140 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cpne6Q9Z140 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cpne6Q9Z140 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpne6Q9Z140 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpne6Q9Z140 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpne6Q9Z140 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpne6Q9Z140 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cpne6Q9Z140 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cpne6Q9Z140 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cpne6Q9Z140 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cpne6Q9Z140 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cpne6Q9Z140 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpne6Q9Z140 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpne6Q9Z140 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cpne6Q9Z140 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cpne6Q9Z140 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpne6Q9Z140 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpne6Q9Z140 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpne6Q9Z140 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpne6Q9Z140 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpne6Q9Z140 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpne6Q9Z140 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpne6Q9Z140 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpne6Q9Z140 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpne6Q9Z140 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpne6Q9Z140 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cpne6Q9Z140 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpne6Q9Z140 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpne6Q9Z140 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpne6Q9Z140 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpne6Q9Z140 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpne6Q9Z140 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpne6Q9Z140 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpne6Q9Z140 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpne6Q9Z140 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpne6Q9Z140 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpne6Q9Z140 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpne6Q9Z140 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpne6Q9Z140 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpne6Q9Z140 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpne6Q9Z140 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpne6Q9Z140 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpne6Q9Z140 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpne6Q9Z140 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpne6Q9Z140 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpne6Q9Z140 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpne6Q9Z140 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpne6Q9Z140 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpne6Q9Z140 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpne6Q9Z140 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpne6Q9Z140 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpne6Q9Z140 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpne6Q9Z140 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpne6Q9Z140 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpne6Q9Z140 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cpne6Q9Z140 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cpne6Q9Z140 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpne6Q9Z140 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpne6Q9Z140 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpne6Q9Z140 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpne6Q9Z140 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpne6Q9Z140 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpne6Q9Z140 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpne6Q9Z140 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpne6Q9Z140 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpne6Q9Z140 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpne6Q9Z140 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms