Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32,45■■■□□ 2,79
Sh3bp5Q9Z131 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Sh3bp5Q9Z131 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Sh3bp5Q9Z131 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Sh3bp5Q9Z131 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32,42■■■□□ 2,78
Sh3bp5Q9Z131 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Sh3bp5Q9Z131 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Sh3bp5Q9Z131 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Sh3bp5Q9Z131 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Sh3bp5Q9Z131 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32,4■■■□□ 2,78
Sh3bp5Q9Z131 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Sh3bp5Q9Z131 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Sh3bp5Q9Z131 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Sh3bp5Q9Z131 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Sh3bp5Q9Z131 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32,36■■■□□ 2,77
Sh3bp5Q9Z131 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32,36■■■□□ 2,77
Sh3bp5Q9Z131 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Sh3bp5Q9Z131 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Sh3bp5Q9Z131 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Sh3bp5Q9Z131 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Sh3bp5Q9Z131 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Sh3bp5Q9Z131 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Sh3bp5Q9Z131 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32,23■■■□□ 2,75
Sh3bp5Q9Z131 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Sh3bp5Q9Z131 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Sh3bp5Q9Z131 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32,2■■■□□ 2,75
Sh3bp5Q9Z131 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,2■■■□□ 2,75
Sh3bp5Q9Z131 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Sh3bp5Q9Z131 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Sh3bp5Q9Z131 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Sh3bp5Q9Z131 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Sh3bp5Q9Z131 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32,12■■■□□ 2,73
Sh3bp5Q9Z131 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Sh3bp5Q9Z131 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Sh3bp5Q9Z131 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32,03■■■□□ 2,72
Sh3bp5Q9Z131 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Sh3bp5Q9Z131 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32,01■■■□□ 2,71
Sh3bp5Q9Z131 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,97■■■□□ 2,71
Sh3bp5Q9Z131 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Sh3bp5Q9Z131 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31,95■■■□□ 2,71
Sh3bp5Q9Z131 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Sh3bp5Q9Z131 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31,94■■■□□ 2,7
Sh3bp5Q9Z131 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Sh3bp5Q9Z131 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Sh3bp5Q9Z131 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31,91■■■□□ 2,7
Sh3bp5Q9Z131 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31,89■■■□□ 2,7
Sh3bp5Q9Z131 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Sh3bp5Q9Z131 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Sh3bp5Q9Z131 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,87■■■□□ 2,69
Sh3bp5Q9Z131 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Sh3bp5Q9Z131 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Sh3bp5Q9Z131 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Sh3bp5Q9Z131 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Sh3bp5Q9Z131 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31,83■■■□□ 2,69
Sh3bp5Q9Z131 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC31,82■■■□□ 2,68
Sh3bp5Q9Z131 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Sh3bp5Q9Z131 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Sh3bp5Q9Z131 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31,78■■■□□ 2,68
Sh3bp5Q9Z131 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Sh3bp5Q9Z131 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,68
Sh3bp5Q9Z131 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Sh3bp5Q9Z131 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31,75■■■□□ 2,67
Sh3bp5Q9Z131 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Sh3bp5Q9Z131 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Sh3bp5Q9Z131 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,7■■■□□ 2,66
Sh3bp5Q9Z131 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Sh3bp5Q9Z131 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Sh3bp5Q9Z131 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Sh3bp5Q9Z131 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC31,66■■■□□ 2,66
Sh3bp5Q9Z131 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Sh3bp5Q9Z131 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Sh3bp5Q9Z131 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Sh3bp5Q9Z131 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Sh3bp5Q9Z131 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31,57■■■□□ 2,64
Sh3bp5Q9Z131 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31,56■■■□□ 2,64
Sh3bp5Q9Z131 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Sh3bp5Q9Z131 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Sh3bp5Q9Z131 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC31,54■■■□□ 2,64
Sh3bp5Q9Z131 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Sh3bp5Q9Z131 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Sh3bp5Q9Z131 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Sh3bp5Q9Z131 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Sh3bp5Q9Z131 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Sh3bp5Q9Z131 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Sh3bp5Q9Z131 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Sh3bp5Q9Z131 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Sh3bp5Q9Z131 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Sh3bp5Q9Z131 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Sh3bp5Q9Z131 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Sh3bp5Q9Z131 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,46■■■□□ 2,63
Sh3bp5Q9Z131 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Sh3bp5Q9Z131 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,45■■■□□ 2,62
Sh3bp5Q9Z131 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,62
Sh3bp5Q9Z131 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Sh3bp5Q9Z131 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,43■■■□□ 2,62
Sh3bp5Q9Z131 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Sh3bp5Q9Z131 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31,42■■■□□ 2,62
Sh3bp5Q9Z131 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Sh3bp5Q9Z131 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms