Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nr1h3Q9Z0Y9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nr1h3Q9Z0Y9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nr1h3Q9Z0Y9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nr1h3Q9Z0Y9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nr1h3Q9Z0Y9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nr1h3Q9Z0Y9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nr1h3Q9Z0Y9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nr1h3Q9Z0Y9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nr1h3Q9Z0Y9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nr1h3Q9Z0Y9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nr1h3Q9Z0Y9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nr1h3Q9Z0Y9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nr1h3Q9Z0Y9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nr1h3Q9Z0Y9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nr1h3Q9Z0Y9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nr1h3Q9Z0Y9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nr1h3Q9Z0Y9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nr1h3Q9Z0Y9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nr1h3Q9Z0Y9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nr1h3Q9Z0Y9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nr1h3Q9Z0Y9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nr1h3Q9Z0Y9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nr1h3Q9Z0Y9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nr1h3Q9Z0Y9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nr1h3Q9Z0Y9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Nr1h3Q9Z0Y9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nr1h3Q9Z0Y9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nr1h3Q9Z0Y9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nr1h3Q9Z0Y9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nr1h3Q9Z0Y9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nr1h3Q9Z0Y9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nr1h3Q9Z0Y9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Nr1h3Q9Z0Y9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nr1h3Q9Z0Y9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nr1h3Q9Z0Y9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nr1h3Q9Z0Y9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nr1h3Q9Z0Y9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nr1h3Q9Z0Y9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nr1h3Q9Z0Y9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nr1h3Q9Z0Y9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nr1h3Q9Z0Y9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nr1h3Q9Z0Y9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nr1h3Q9Z0Y9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nr1h3Q9Z0Y9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nr1h3Q9Z0Y9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nr1h3Q9Z0Y9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nr1h3Q9Z0Y9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nr1h3Q9Z0Y9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nr1h3Q9Z0Y9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nr1h3Q9Z0Y9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nr1h3Q9Z0Y9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nr1h3Q9Z0Y9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nr1h3Q9Z0Y9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nr1h3Q9Z0Y9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nr1h3Q9Z0Y9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nr1h3Q9Z0Y9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nr1h3Q9Z0Y9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms