Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arpc1bQ9WV32 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arpc1bQ9WV32 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Arpc1bQ9WV32 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arpc1bQ9WV32 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arpc1bQ9WV32 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arpc1bQ9WV32 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arpc1bQ9WV32 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arpc1bQ9WV32 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arpc1bQ9WV32 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arpc1bQ9WV32 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arpc1bQ9WV32 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arpc1bQ9WV32 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Arpc1bQ9WV32 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arpc1bQ9WV32 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arpc1bQ9WV32 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Arpc1bQ9WV32 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Arpc1bQ9WV32 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arpc1bQ9WV32 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arpc1bQ9WV32 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arpc1bQ9WV32 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arpc1bQ9WV32 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arpc1bQ9WV32 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arpc1bQ9WV32 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arpc1bQ9WV32 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arpc1bQ9WV32 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arpc1bQ9WV32 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arpc1bQ9WV32 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Arpc1bQ9WV32 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arpc1bQ9WV32 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arpc1bQ9WV32 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arpc1bQ9WV32 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Arpc1bQ9WV32 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arpc1bQ9WV32 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arpc1bQ9WV32 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arpc1bQ9WV32 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arpc1bQ9WV32 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arpc1bQ9WV32 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arpc1bQ9WV32 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arpc1bQ9WV32 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Arpc1bQ9WV32 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arpc1bQ9WV32 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arpc1bQ9WV32 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arpc1bQ9WV32 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arpc1bQ9WV32 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arpc1bQ9WV32 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Arpc1bQ9WV32 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arpc1bQ9WV32 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arpc1bQ9WV32 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arpc1bQ9WV32 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arpc1bQ9WV32 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arpc1bQ9WV32 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Arpc1bQ9WV32 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arpc1bQ9WV32 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arpc1bQ9WV32 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arpc1bQ9WV32 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arpc1bQ9WV32 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arpc1bQ9WV32 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arpc1bQ9WV32 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arpc1bQ9WV32 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Arpc1bQ9WV32 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Arpc1bQ9WV32 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arpc1bQ9WV32 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arpc1bQ9WV32 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arpc1bQ9WV32 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arpc1bQ9WV32 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arpc1bQ9WV32 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Arpc1bQ9WV32 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arpc1bQ9WV32 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arpc1bQ9WV32 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Arpc1bQ9WV32 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arpc1bQ9WV32 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arpc1bQ9WV32 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arpc1bQ9WV32 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arpc1bQ9WV32 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Arpc1bQ9WV32 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Arpc1bQ9WV32 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Arpc1bQ9WV32 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Arpc1bQ9WV32 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Arpc1bQ9WV32 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Arpc1bQ9WV32 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Arpc1bQ9WV32 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Arpc1bQ9WV32 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Arpc1bQ9WV32 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Arpc1bQ9WV32 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Arpc1bQ9WV32 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arpc1bQ9WV32 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arpc1bQ9WV32 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arpc1bQ9WV32 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arpc1bQ9WV32 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arpc1bQ9WV32 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arpc1bQ9WV32 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arpc1bQ9WV32 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arpc1bQ9WV32 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arpc1bQ9WV32 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arpc1bQ9WV32 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arpc1bQ9WV32 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arpc1bQ9WV32 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arpc1bQ9WV32 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arpc1bQ9WV32 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms