Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmb3Q9R1P1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb3Q9R1P1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb3Q9R1P1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb3Q9R1P1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb3Q9R1P1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmb3Q9R1P1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmb3Q9R1P1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmb3Q9R1P1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmb3Q9R1P1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmb3Q9R1P1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmb3Q9R1P1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmb3Q9R1P1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb3Q9R1P1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb3Q9R1P1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb3Q9R1P1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb3Q9R1P1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psmb3Q9R1P1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psmb3Q9R1P1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb3Q9R1P1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb3Q9R1P1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb3Q9R1P1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb3Q9R1P1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb3Q9R1P1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb3Q9R1P1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb3Q9R1P1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb3Q9R1P1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb3Q9R1P1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmb3Q9R1P1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmb3Q9R1P1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmb3Q9R1P1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmb3Q9R1P1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmb3Q9R1P1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb3Q9R1P1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psmb3Q9R1P1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Psmb3Q9R1P1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Psmb3Q9R1P1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Psmb3Q9R1P1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Psmb3Q9R1P1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb3Q9R1P1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb3Q9R1P1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psmb3Q9R1P1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psmb3Q9R1P1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psmb3Q9R1P1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb3Q9R1P1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psmb3Q9R1P1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb3Q9R1P1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb3Q9R1P1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb3Q9R1P1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb3Q9R1P1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb3Q9R1P1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb3Q9R1P1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb3Q9R1P1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmb3Q9R1P1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb3Q9R1P1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb3Q9R1P1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb3Q9R1P1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmb3Q9R1P1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Psmb3Q9R1P1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmb3Q9R1P1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmb3Q9R1P1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psmb3Q9R1P1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmb3Q9R1P1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psmb3Q9R1P1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psmb3Q9R1P1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmb3Q9R1P1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmb3Q9R1P1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmb3Q9R1P1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmb3Q9R1P1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmb3Q9R1P1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmb3Q9R1P1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmb3Q9R1P1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmb3Q9R1P1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Psmb3Q9R1P1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psmb3Q9R1P1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psmb3Q9R1P1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psmb3Q9R1P1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmb3Q9R1P1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmb3Q9R1P1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmb3Q9R1P1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb3Q9R1P1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb3Q9R1P1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb3Q9R1P1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psmb3Q9R1P1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psmb3Q9R1P1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psmb3Q9R1P1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psmb3Q9R1P1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psmb3Q9R1P1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Psmb3Q9R1P1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmb3Q9R1P1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb3Q9R1P1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb3Q9R1P1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb3Q9R1P1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb3Q9R1P1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb3Q9R1P1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb3Q9R1P1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb3Q9R1P1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms