Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nphs1Q9QZS7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nphs1Q9QZS7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nphs1Q9QZS7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nphs1Q9QZS7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nphs1Q9QZS7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nphs1Q9QZS7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nphs1Q9QZS7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Nphs1Q9QZS7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nphs1Q9QZS7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nphs1Q9QZS7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nphs1Q9QZS7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nphs1Q9QZS7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nphs1Q9QZS7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nphs1Q9QZS7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nphs1Q9QZS7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nphs1Q9QZS7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Nphs1Q9QZS7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nphs1Q9QZS7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nphs1Q9QZS7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nphs1Q9QZS7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nphs1Q9QZS7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nphs1Q9QZS7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Nphs1Q9QZS7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nphs1Q9QZS7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphs1Q9QZS7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nphs1Q9QZS7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphs1Q9QZS7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphs1Q9QZS7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nphs1Q9QZS7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphs1Q9QZS7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphs1Q9QZS7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphs1Q9QZS7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphs1Q9QZS7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphs1Q9QZS7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nphs1Q9QZS7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphs1Q9QZS7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nphs1Q9QZS7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nphs1Q9QZS7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nphs1Q9QZS7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nphs1Q9QZS7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nphs1Q9QZS7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nphs1Q9QZS7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nphs1Q9QZS7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nphs1Q9QZS7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nphs1Q9QZS7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nphs1Q9QZS7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphs1Q9QZS7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphs1Q9QZS7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nphs1Q9QZS7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nphs1Q9QZS7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nphs1Q9QZS7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphs1Q9QZS7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphs1Q9QZS7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nphs1Q9QZS7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nphs1Q9QZS7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nphs1Q9QZS7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphs1Q9QZS7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphs1Q9QZS7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Nphs1Q9QZS7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphs1Q9QZS7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphs1Q9QZS7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphs1Q9QZS7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphs1Q9QZS7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphs1Q9QZS7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphs1Q9QZS7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphs1Q9QZS7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphs1Q9QZS7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nphs1Q9QZS7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nphs1Q9QZS7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nphs1Q9QZS7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphs1Q9QZS7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphs1Q9QZS7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphs1Q9QZS7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphs1Q9QZS7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nphs1Q9QZS7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphs1Q9QZS7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nphs1Q9QZS7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nphs1Q9QZS7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Nphs1Q9QZS7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nphs1Q9QZS7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nphs1Q9QZS7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphs1Q9QZS7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nphs1Q9QZS7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nphs1Q9QZS7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nphs1Q9QZS7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nphs1Q9QZS7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphs1Q9QZS7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphs1Q9QZS7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphs1Q9QZS7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nphs1Q9QZS7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nphs1Q9QZS7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphs1Q9QZS7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphs1Q9QZS7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nphs1Q9QZS7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nphs1Q9QZS7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nphs1Q9QZS7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphs1Q9QZS7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nphs1Q9QZS7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nphs1Q9QZS7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms