Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ15

Clec4a, C-type lectin domain family 4 member A, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4aQ9QZ15 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clec4aQ9QZ15 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clec4aQ9QZ15 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clec4aQ9QZ15 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Clec4aQ9QZ15 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clec4aQ9QZ15 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Clec4aQ9QZ15 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Clec4aQ9QZ15 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clec4aQ9QZ15 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clec4aQ9QZ15 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clec4aQ9QZ15 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Clec4aQ9QZ15 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clec4aQ9QZ15 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clec4aQ9QZ15 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clec4aQ9QZ15 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clec4aQ9QZ15 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clec4aQ9QZ15 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clec4aQ9QZ15 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clec4aQ9QZ15 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Clec4aQ9QZ15 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Clec4aQ9QZ15 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clec4aQ9QZ15 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clec4aQ9QZ15 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clec4aQ9QZ15 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clec4aQ9QZ15 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clec4aQ9QZ15 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Clec4aQ9QZ15 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clec4aQ9QZ15 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Clec4aQ9QZ15 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Clec4aQ9QZ15 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Clec4aQ9QZ15 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clec4aQ9QZ15 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clec4aQ9QZ15 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clec4aQ9QZ15 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clec4aQ9QZ15 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clec4aQ9QZ15 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Clec4aQ9QZ15 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clec4aQ9QZ15 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clec4aQ9QZ15 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clec4aQ9QZ15 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clec4aQ9QZ15 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clec4aQ9QZ15 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clec4aQ9QZ15 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clec4aQ9QZ15 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clec4aQ9QZ15 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Clec4aQ9QZ15 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clec4aQ9QZ15 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clec4aQ9QZ15 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clec4aQ9QZ15 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clec4aQ9QZ15 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clec4aQ9QZ15 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clec4aQ9QZ15 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clec4aQ9QZ15 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clec4aQ9QZ15 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clec4aQ9QZ15 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clec4aQ9QZ15 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clec4aQ9QZ15 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clec4aQ9QZ15 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clec4aQ9QZ15 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clec4aQ9QZ15 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clec4aQ9QZ15 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clec4aQ9QZ15 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clec4aQ9QZ15 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clec4aQ9QZ15 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clec4aQ9QZ15 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Clec4aQ9QZ15 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clec4aQ9QZ15 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clec4aQ9QZ15 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clec4aQ9QZ15 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clec4aQ9QZ15 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clec4aQ9QZ15 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clec4aQ9QZ15 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clec4aQ9QZ15 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clec4aQ9QZ15 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clec4aQ9QZ15 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clec4aQ9QZ15 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clec4aQ9QZ15 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Clec4aQ9QZ15 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clec4aQ9QZ15 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clec4aQ9QZ15 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clec4aQ9QZ15 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clec4aQ9QZ15 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clec4aQ9QZ15 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clec4aQ9QZ15 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clec4aQ9QZ15 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clec4aQ9QZ15 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clec4aQ9QZ15 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clec4aQ9QZ15 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clec4aQ9QZ15 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clec4aQ9QZ15 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Clec4aQ9QZ15 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clec4aQ9QZ15 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clec4aQ9QZ15 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Clec4aQ9QZ15 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clec4aQ9QZ15 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clec4aQ9QZ15 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clec4aQ9QZ15 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clec4aQ9QZ15 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clec4aQ9QZ15 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clec4aQ9QZ15 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms