Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
ChmQ9QXG2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,98■■■□□ 2,07
ChmQ9QXG2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
ChmQ9QXG2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,95■■■□□ 2,06
ChmQ9QXG2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,95■■■□□ 2,06
ChmQ9QXG2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
ChmQ9QXG2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
ChmQ9QXG2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
ChmQ9QXG2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
ChmQ9QXG2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
ChmQ9QXG2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
ChmQ9QXG2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
ChmQ9QXG2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
ChmQ9QXG2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,87■■■□□ 2,05
ChmQ9QXG2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
ChmQ9QXG2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
ChmQ9QXG2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
ChmQ9QXG2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
ChmQ9QXG2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
ChmQ9QXG2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
ChmQ9QXG2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
ChmQ9QXG2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
ChmQ9QXG2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
ChmQ9QXG2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
ChmQ9QXG2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
ChmQ9QXG2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
ChmQ9QXG2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
ChmQ9QXG2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
ChmQ9QXG2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
ChmQ9QXG2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
ChmQ9QXG2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27,75■■■□□ 2,03
ChmQ9QXG2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
ChmQ9QXG2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
ChmQ9QXG2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,02
ChmQ9QXG2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
ChmQ9QXG2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,68■■■□□ 2,02
ChmQ9QXG2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
ChmQ9QXG2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
ChmQ9QXG2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
ChmQ9QXG2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
ChmQ9QXG2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,65■■■□□ 2,02
ChmQ9QXG2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
ChmQ9QXG2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
ChmQ9QXG2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
ChmQ9QXG2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
ChmQ9QXG2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
ChmQ9QXG2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
ChmQ9QXG2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
ChmQ9QXG2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
ChmQ9QXG2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
ChmQ9QXG2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
ChmQ9QXG2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
ChmQ9QXG2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
ChmQ9QXG2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
ChmQ9QXG2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
ChmQ9QXG2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,53■■■□□ 2
ChmQ9QXG2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
ChmQ9QXG2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
ChmQ9QXG2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
ChmQ9QXG2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
ChmQ9QXG2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,47■■□□□ 1,99
ChmQ9QXG2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
ChmQ9QXG2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
ChmQ9QXG2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
ChmQ9QXG2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
ChmQ9QXG2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
ChmQ9QXG2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
ChmQ9QXG2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27,42■■□□□ 1,98
ChmQ9QXG2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
ChmQ9QXG2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27,39■■□□□ 1,98
ChmQ9QXG2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
ChmQ9QXG2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
ChmQ9QXG2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
ChmQ9QXG2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
ChmQ9QXG2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
ChmQ9QXG2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
ChmQ9QXG2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
ChmQ9QXG2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
ChmQ9QXG2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
ChmQ9QXG2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
ChmQ9QXG2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
ChmQ9QXG2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,29■■□□□ 1,96
ChmQ9QXG2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
ChmQ9QXG2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
ChmQ9QXG2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
ChmQ9QXG2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
ChmQ9QXG2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
ChmQ9QXG2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
ChmQ9QXG2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
ChmQ9QXG2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
ChmQ9QXG2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
ChmQ9QXG2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,21■■□□□ 1,95
ChmQ9QXG2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
ChmQ9QXG2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
ChmQ9QXG2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,18■■□□□ 1,94
ChmQ9QXG2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
ChmQ9QXG2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
ChmQ9QXG2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
ChmQ9QXG2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
ChmQ9QXG2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,9 ms