Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Higd1aQ9JLR9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Higd1aQ9JLR9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Higd1aQ9JLR9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Higd1aQ9JLR9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Higd1aQ9JLR9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Higd1aQ9JLR9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Higd1aQ9JLR9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Higd1aQ9JLR9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Higd1aQ9JLR9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Higd1aQ9JLR9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Higd1aQ9JLR9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Higd1aQ9JLR9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Higd1aQ9JLR9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Higd1aQ9JLR9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Higd1aQ9JLR9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Higd1aQ9JLR9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Higd1aQ9JLR9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Higd1aQ9JLR9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Higd1aQ9JLR9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Higd1aQ9JLR9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Higd1aQ9JLR9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Higd1aQ9JLR9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Higd1aQ9JLR9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Higd1aQ9JLR9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Higd1aQ9JLR9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Higd1aQ9JLR9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Higd1aQ9JLR9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Higd1aQ9JLR9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Higd1aQ9JLR9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Higd1aQ9JLR9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Higd1aQ9JLR9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Higd1aQ9JLR9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Higd1aQ9JLR9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Higd1aQ9JLR9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Higd1aQ9JLR9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Higd1aQ9JLR9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Higd1aQ9JLR9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Higd1aQ9JLR9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Higd1aQ9JLR9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Higd1aQ9JLR9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Higd1aQ9JLR9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Higd1aQ9JLR9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Higd1aQ9JLR9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Higd1aQ9JLR9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Higd1aQ9JLR9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Higd1aQ9JLR9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Higd1aQ9JLR9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Higd1aQ9JLR9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Higd1aQ9JLR9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Higd1aQ9JLR9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Higd1aQ9JLR9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Higd1aQ9JLR9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Higd1aQ9JLR9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Higd1aQ9JLR9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Higd1aQ9JLR9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Higd1aQ9JLR9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Higd1aQ9JLR9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Higd1aQ9JLR9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Higd1aQ9JLR9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Higd1aQ9JLR9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Higd1aQ9JLR9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Higd1aQ9JLR9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd1aQ9JLR9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd1aQ9JLR9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd1aQ9JLR9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Higd1aQ9JLR9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Higd1aQ9JLR9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Higd1aQ9JLR9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd1aQ9JLR9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd1aQ9JLR9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd1aQ9JLR9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd1aQ9JLR9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd1aQ9JLR9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd1aQ9JLR9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd1aQ9JLR9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd1aQ9JLR9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd1aQ9JLR9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms