Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC4

Sorcs1, VPS10 domain-containing receptor SorCS1, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorcs1Q9JLC4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sorcs1Q9JLC4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sorcs1Q9JLC4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sorcs1Q9JLC4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sorcs1Q9JLC4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sorcs1Q9JLC4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sorcs1Q9JLC4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sorcs1Q9JLC4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sorcs1Q9JLC4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sorcs1Q9JLC4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sorcs1Q9JLC4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sorcs1Q9JLC4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sorcs1Q9JLC4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sorcs1Q9JLC4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sorcs1Q9JLC4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sorcs1Q9JLC4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sorcs1Q9JLC4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sorcs1Q9JLC4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sorcs1Q9JLC4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sorcs1Q9JLC4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sorcs1Q9JLC4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sorcs1Q9JLC4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sorcs1Q9JLC4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sorcs1Q9JLC4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sorcs1Q9JLC4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sorcs1Q9JLC4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sorcs1Q9JLC4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sorcs1Q9JLC4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sorcs1Q9JLC4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sorcs1Q9JLC4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sorcs1Q9JLC4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sorcs1Q9JLC4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sorcs1Q9JLC4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sorcs1Q9JLC4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sorcs1Q9JLC4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sorcs1Q9JLC4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sorcs1Q9JLC4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sorcs1Q9JLC4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sorcs1Q9JLC4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sorcs1Q9JLC4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sorcs1Q9JLC4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sorcs1Q9JLC4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sorcs1Q9JLC4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sorcs1Q9JLC4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sorcs1Q9JLC4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sorcs1Q9JLC4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sorcs1Q9JLC4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sorcs1Q9JLC4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sorcs1Q9JLC4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sorcs1Q9JLC4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sorcs1Q9JLC4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sorcs1Q9JLC4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sorcs1Q9JLC4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sorcs1Q9JLC4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sorcs1Q9JLC4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sorcs1Q9JLC4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sorcs1Q9JLC4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sorcs1Q9JLC4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sorcs1Q9JLC4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sorcs1Q9JLC4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sorcs1Q9JLC4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sorcs1Q9JLC4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sorcs1Q9JLC4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sorcs1Q9JLC4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sorcs1Q9JLC4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sorcs1Q9JLC4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sorcs1Q9JLC4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sorcs1Q9JLC4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sorcs1Q9JLC4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sorcs1Q9JLC4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sorcs1Q9JLC4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sorcs1Q9JLC4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sorcs1Q9JLC4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sorcs1Q9JLC4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sorcs1Q9JLC4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sorcs1Q9JLC4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sorcs1Q9JLC4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sorcs1Q9JLC4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sorcs1Q9JLC4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sorcs1Q9JLC4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sorcs1Q9JLC4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sorcs1Q9JLC4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sorcs1Q9JLC4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sorcs1Q9JLC4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sorcs1Q9JLC4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sorcs1Q9JLC4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sorcs1Q9JLC4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sorcs1Q9JLC4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sorcs1Q9JLC4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sorcs1Q9JLC4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sorcs1Q9JLC4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sorcs1Q9JLC4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sorcs1Q9JLC4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sorcs1Q9JLC4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sorcs1Q9JLC4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sorcs1Q9JLC4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sorcs1Q9JLC4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sorcs1Q9JLC4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sorcs1Q9JLC4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sorcs1Q9JLC4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms