Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Hmgn5Q9JL35 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hmgn5Q9JL35 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hmgn5Q9JL35 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hmgn5Q9JL35 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hmgn5Q9JL35 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hmgn5Q9JL35 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hmgn5Q9JL35 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hmgn5Q9JL35 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hmgn5Q9JL35 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hmgn5Q9JL35 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hmgn5Q9JL35 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hmgn5Q9JL35 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hmgn5Q9JL35 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Hmgn5Q9JL35 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hmgn5Q9JL35 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Hmgn5Q9JL35 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hmgn5Q9JL35 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Hmgn5Q9JL35 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hmgn5Q9JL35 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hmgn5Q9JL35 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hmgn5Q9JL35 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hmgn5Q9JL35 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hmgn5Q9JL35 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Hmgn5Q9JL35 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hmgn5Q9JL35 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hmgn5Q9JL35 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Hmgn5Q9JL35 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hmgn5Q9JL35 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hmgn5Q9JL35 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hmgn5Q9JL35 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hmgn5Q9JL35 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hmgn5Q9JL35 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hmgn5Q9JL35 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hmgn5Q9JL35 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hmgn5Q9JL35 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hmgn5Q9JL35 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hmgn5Q9JL35 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hmgn5Q9JL35 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hmgn5Q9JL35 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hmgn5Q9JL35 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hmgn5Q9JL35 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hmgn5Q9JL35 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hmgn5Q9JL35 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hmgn5Q9JL35 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hmgn5Q9JL35 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hmgn5Q9JL35 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hmgn5Q9JL35 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Hmgn5Q9JL35 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hmgn5Q9JL35 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hmgn5Q9JL35 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hmgn5Q9JL35 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hmgn5Q9JL35 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hmgn5Q9JL35 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hmgn5Q9JL35 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Hmgn5Q9JL35 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hmgn5Q9JL35 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hmgn5Q9JL35 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hmgn5Q9JL35 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hmgn5Q9JL35 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hmgn5Q9JL35 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hmgn5Q9JL35 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Hmgn5Q9JL35 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Hmgn5Q9JL35 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Hmgn5Q9JL35 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hmgn5Q9JL35 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hmgn5Q9JL35 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hmgn5Q9JL35 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hmgn5Q9JL35 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hmgn5Q9JL35 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hmgn5Q9JL35 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hmgn5Q9JL35 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hmgn5Q9JL35 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hmgn5Q9JL35 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Hmgn5Q9JL35 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Hmgn5Q9JL35 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hmgn5Q9JL35 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hmgn5Q9JL35 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hmgn5Q9JL35 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hmgn5Q9JL35 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hmgn5Q9JL35 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Hmgn5Q9JL35 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hmgn5Q9JL35 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hmgn5Q9JL35 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hmgn5Q9JL35 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hmgn5Q9JL35 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hmgn5Q9JL35 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hmgn5Q9JL35 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Hmgn5Q9JL35 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Hmgn5Q9JL35 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hmgn5Q9JL35 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Hmgn5Q9JL35 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hmgn5Q9JL35 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hmgn5Q9JL35 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hmgn5Q9JL35 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hmgn5Q9JL35 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hmgn5Q9JL35 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hmgn5Q9JL35 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms