Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL26

Fmnl1, Formin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,094 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmnl1Q9JL26 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fmnl1Q9JL26 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Fmnl1Q9JL26 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fmnl1Q9JL26 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fmnl1Q9JL26 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fmnl1Q9JL26 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fmnl1Q9JL26 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fmnl1Q9JL26 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fmnl1Q9JL26 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Fmnl1Q9JL26 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fmnl1Q9JL26 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fmnl1Q9JL26 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fmnl1Q9JL26 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fmnl1Q9JL26 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fmnl1Q9JL26 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fmnl1Q9JL26 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fmnl1Q9JL26 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fmnl1Q9JL26 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fmnl1Q9JL26 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fmnl1Q9JL26 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fmnl1Q9JL26 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fmnl1Q9JL26 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fmnl1Q9JL26 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fmnl1Q9JL26 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fmnl1Q9JL26 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fmnl1Q9JL26 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fmnl1Q9JL26 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fmnl1Q9JL26 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fmnl1Q9JL26 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fmnl1Q9JL26 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fmnl1Q9JL26 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fmnl1Q9JL26 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Fmnl1Q9JL26 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fmnl1Q9JL26 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fmnl1Q9JL26 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fmnl1Q9JL26 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fmnl1Q9JL26 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fmnl1Q9JL26 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Fmnl1Q9JL26 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fmnl1Q9JL26 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fmnl1Q9JL26 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fmnl1Q9JL26 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Fmnl1Q9JL26 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fmnl1Q9JL26 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Fmnl1Q9JL26 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Fmnl1Q9JL26 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fmnl1Q9JL26 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fmnl1Q9JL26 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fmnl1Q9JL26 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fmnl1Q9JL26 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fmnl1Q9JL26 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fmnl1Q9JL26 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fmnl1Q9JL26 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fmnl1Q9JL26 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fmnl1Q9JL26 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fmnl1Q9JL26 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fmnl1Q9JL26 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fmnl1Q9JL26 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fmnl1Q9JL26 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fmnl1Q9JL26 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fmnl1Q9JL26 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fmnl1Q9JL26 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fmnl1Q9JL26 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Fmnl1Q9JL26 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fmnl1Q9JL26 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fmnl1Q9JL26 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fmnl1Q9JL26 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fmnl1Q9JL26 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fmnl1Q9JL26 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fmnl1Q9JL26 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fmnl1Q9JL26 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fmnl1Q9JL26 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fmnl1Q9JL26 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fmnl1Q9JL26 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fmnl1Q9JL26 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fmnl1Q9JL26 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fmnl1Q9JL26 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fmnl1Q9JL26 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Fmnl1Q9JL26 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fmnl1Q9JL26 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fmnl1Q9JL26 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fmnl1Q9JL26 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fmnl1Q9JL26 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fmnl1Q9JL26 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fmnl1Q9JL26 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fmnl1Q9JL26 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fmnl1Q9JL26 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fmnl1Q9JL26 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Fmnl1Q9JL26 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fmnl1Q9JL26 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fmnl1Q9JL26 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fmnl1Q9JL26 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fmnl1Q9JL26 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fmnl1Q9JL26 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fmnl1Q9JL26 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fmnl1Q9JL26 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmnl1Q9JL26 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmnl1Q9JL26 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmnl1Q9JL26 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fmnl1Q9JL26 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms