Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Rcan3Q9JKK0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Rcan3Q9JKK0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Rcan3Q9JKK0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Rcan3Q9JKK0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Rcan3Q9JKK0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Rcan3Q9JKK0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Rcan3Q9JKK0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Rcan3Q9JKK0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
Rcan3Q9JKK0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Rcan3Q9JKK0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Rcan3Q9JKK0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Rcan3Q9JKK0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Rcan3Q9JKK0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Rcan3Q9JKK0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Rcan3Q9JKK0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Rcan3Q9JKK0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Rcan3Q9JKK0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Rcan3Q9JKK0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Rcan3Q9JKK0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Rcan3Q9JKK0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Rcan3Q9JKK0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Rcan3Q9JKK0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Rcan3Q9JKK0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Rcan3Q9JKK0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Rcan3Q9JKK0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Rcan3Q9JKK0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Rcan3Q9JKK0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Rcan3Q9JKK0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,27
Rcan3Q9JKK0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Rcan3Q9JKK0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Rcan3Q9JKK0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Rcan3Q9JKK0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Rcan3Q9JKK0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29,17■■■□□ 2,26
Rcan3Q9JKK0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Rcan3Q9JKK0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Rcan3Q9JKK0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Rcan3Q9JKK0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Rcan3Q9JKK0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Rcan3Q9JKK0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Rcan3Q9JKK0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Rcan3Q9JKK0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Rcan3Q9JKK0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Rcan3Q9JKK0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Rcan3Q9JKK0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Rcan3Q9JKK0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Rcan3Q9JKK0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Rcan3Q9JKK0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Rcan3Q9JKK0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Rcan3Q9JKK0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Rcan3Q9JKK0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Rcan3Q9JKK0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Rcan3Q9JKK0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Rcan3Q9JKK0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Rcan3Q9JKK0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Rcan3Q9JKK0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Rcan3Q9JKK0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Rcan3Q9JKK0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Rcan3Q9JKK0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Rcan3Q9JKK0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Rcan3Q9JKK0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Rcan3Q9JKK0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Rcan3Q9JKK0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Rcan3Q9JKK0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Rcan3Q9JKK0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Rcan3Q9JKK0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Rcan3Q9JKK0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Rcan3Q9JKK0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28,82■■■□□ 2,2
Rcan3Q9JKK0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Rcan3Q9JKK0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Rcan3Q9JKK0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Rcan3Q9JKK0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Rcan3Q9JKK0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Rcan3Q9JKK0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Rcan3Q9JKK0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
Rcan3Q9JKK0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Rcan3Q9JKK0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Rcan3Q9JKK0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Rcan3Q9JKK0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Rcan3Q9JKK0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Rcan3Q9JKK0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Rcan3Q9JKK0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Rcan3Q9JKK0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Rcan3Q9JKK0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Rcan3Q9JKK0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Rcan3Q9JKK0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Rcan3Q9JKK0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rcan3Q9JKK0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,64■■■□□ 2,17
Rcan3Q9JKK0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Rcan3Q9JKK0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,61■■■□□ 2,17
Rcan3Q9JKK0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Rcan3Q9JKK0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Rcan3Q9JKK0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Rcan3Q9JKK0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Rcan3Q9JKK0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Rcan3Q9JKK0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Rcan3Q9JKK0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Rcan3Q9JKK0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Rcan3Q9JKK0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Rcan3Q9JKK0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms