Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trem3Q9JKE1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trem3Q9JKE1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trem3Q9JKE1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trem3Q9JKE1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trem3Q9JKE1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trem3Q9JKE1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trem3Q9JKE1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trem3Q9JKE1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trem3Q9JKE1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trem3Q9JKE1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trem3Q9JKE1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Trem3Q9JKE1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trem3Q9JKE1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trem3Q9JKE1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trem3Q9JKE1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trem3Q9JKE1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trem3Q9JKE1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trem3Q9JKE1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trem3Q9JKE1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trem3Q9JKE1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trem3Q9JKE1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trem3Q9JKE1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trem3Q9JKE1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trem3Q9JKE1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trem3Q9JKE1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trem3Q9JKE1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trem3Q9JKE1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trem3Q9JKE1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trem3Q9JKE1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trem3Q9JKE1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trem3Q9JKE1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trem3Q9JKE1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trem3Q9JKE1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trem3Q9JKE1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trem3Q9JKE1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trem3Q9JKE1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trem3Q9JKE1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trem3Q9JKE1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trem3Q9JKE1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trem3Q9JKE1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trem3Q9JKE1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trem3Q9JKE1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trem3Q9JKE1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Trem3Q9JKE1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trem3Q9JKE1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trem3Q9JKE1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trem3Q9JKE1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trem3Q9JKE1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trem3Q9JKE1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Trem3Q9JKE1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trem3Q9JKE1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trem3Q9JKE1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trem3Q9JKE1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trem3Q9JKE1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trem3Q9JKE1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trem3Q9JKE1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trem3Q9JKE1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trem3Q9JKE1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trem3Q9JKE1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trem3Q9JKE1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trem3Q9JKE1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trem3Q9JKE1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Trem3Q9JKE1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trem3Q9JKE1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trem3Q9JKE1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trem3Q9JKE1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trem3Q9JKE1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trem3Q9JKE1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trem3Q9JKE1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trem3Q9JKE1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trem3Q9JKE1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trem3Q9JKE1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trem3Q9JKE1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trem3Q9JKE1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trem3Q9JKE1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trem3Q9JKE1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trem3Q9JKE1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trem3Q9JKE1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trem3Q9JKE1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trem3Q9JKE1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trem3Q9JKE1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trem3Q9JKE1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trem3Q9JKE1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trem3Q9JKE1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trem3Q9JKE1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trem3Q9JKE1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trem3Q9JKE1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trem3Q9JKE1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trem3Q9JKE1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trem3Q9JKE1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trem3Q9JKE1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trem3Q9JKE1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trem3Q9JKE1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trem3Q9JKE1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trem3Q9JKE1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trem3Q9JKE1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trem3Q9JKE1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trem3Q9JKE1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trem3Q9JKE1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms