Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Rpf2Q9JJ80 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Rpf2Q9JJ80 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Rpf2Q9JJ80 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Rpf2Q9JJ80 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Rpf2Q9JJ80 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Rpf2Q9JJ80 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Rpf2Q9JJ80 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Rpf2Q9JJ80 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Rpf2Q9JJ80 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Rpf2Q9JJ80 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Rpf2Q9JJ80 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Rpf2Q9JJ80 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Rpf2Q9JJ80 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
Rpf2Q9JJ80 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Rpf2Q9JJ80 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Rpf2Q9JJ80 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
Rpf2Q9JJ80 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Rpf2Q9JJ80 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Rpf2Q9JJ80 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Rpf2Q9JJ80 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,75■■■□□ 2,03
Rpf2Q9JJ80 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Rpf2Q9JJ80 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Rpf2Q9JJ80 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,73■■■□□ 2,03
Rpf2Q9JJ80 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Rpf2Q9JJ80 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Rpf2Q9JJ80 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Rpf2Q9JJ80 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Rpf2Q9JJ80 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Rpf2Q9JJ80 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Rpf2Q9JJ80 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Rpf2Q9JJ80 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Rpf2Q9JJ80 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Rpf2Q9JJ80 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Rpf2Q9JJ80 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Rpf2Q9JJ80 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Rpf2Q9JJ80 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Rpf2Q9JJ80 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,64■■■□□ 2,01
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,01
Rpf2Q9JJ80 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Rpf2Q9JJ80 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Rpf2Q9JJ80 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Rpf2Q9JJ80 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2
Rpf2Q9JJ80 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2
Rpf2Q9JJ80 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Rpf2Q9JJ80 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Rpf2Q9JJ80 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
Rpf2Q9JJ80 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Rpf2Q9JJ80 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Rpf2Q9JJ80 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Rpf2Q9JJ80 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Rpf2Q9JJ80 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Rpf2Q9JJ80 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
Rpf2Q9JJ80 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Rpf2Q9JJ80 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rpf2Q9JJ80 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rpf2Q9JJ80 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rpf2Q9JJ80 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Rpf2Q9JJ80 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Rpf2Q9JJ80 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Rpf2Q9JJ80 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Rpf2Q9JJ80 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Rpf2Q9JJ80 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Rpf2Q9JJ80 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Rpf2Q9JJ80 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Rpf2Q9JJ80 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Rpf2Q9JJ80 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Rpf2Q9JJ80 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Rpf2Q9JJ80 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,28■■□□□ 1,96
Rpf2Q9JJ80 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Rpf2Q9JJ80 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Rpf2Q9JJ80 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Rpf2Q9JJ80 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Rpf2Q9JJ80 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Rpf2Q9JJ80 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Rpf2Q9JJ80 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Rpf2Q9JJ80 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Rpf2Q9JJ80 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Rpf2Q9JJ80 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Rpf2Q9JJ80 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Rpf2Q9JJ80 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Rpf2Q9JJ80 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Rpf2Q9JJ80 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Rpf2Q9JJ80 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Rpf2Q9JJ80 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Rpf2Q9JJ80 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Rpf2Q9JJ80 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Rpf2Q9JJ80 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Rpf2Q9JJ80 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Rpf2Q9JJ80 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Rpf2Q9JJ80 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
Rpf2Q9JJ80 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Rpf2Q9JJ80 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Rpf2Q9JJ80 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Rpf2Q9JJ80 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Rpf2Q9JJ80 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Rpf2Q9JJ80 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Rpf2Q9JJ80 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Rpf2Q9JJ80 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms