Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31,54■■■□□ 2,64
Cxcl11Q9JHH5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Cxcl11Q9JHH5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Cxcl11Q9JHH5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Cxcl11Q9JHH5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Cxcl11Q9JHH5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Cxcl11Q9JHH5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Cxcl11Q9JHH5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Cxcl11Q9JHH5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31,46■■■□□ 2,63
Cxcl11Q9JHH5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Cxcl11Q9JHH5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,43■■■□□ 2,62
Cxcl11Q9JHH5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Cxcl11Q9JHH5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Cxcl11Q9JHH5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Cxcl11Q9JHH5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Cxcl11Q9JHH5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Cxcl11Q9JHH5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31,35■■■□□ 2,61
Cxcl11Q9JHH5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Cxcl11Q9JHH5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31,32■■■□□ 2,6
Cxcl11Q9JHH5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Cxcl11Q9JHH5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31,3■■■□□ 2,6
Cxcl11Q9JHH5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Cxcl11Q9JHH5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Cxcl11Q9JHH5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Cxcl11Q9JHH5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Cxcl11Q9JHH5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Cxcl11Q9JHH5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Cxcl11Q9JHH5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Cxcl11Q9JHH5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Cxcl11Q9JHH5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Cxcl11Q9JHH5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Cxcl11Q9JHH5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Cxcl11Q9JHH5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Cxcl11Q9JHH5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Cxcl11Q9JHH5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Cxcl11Q9JHH5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Cxcl11Q9JHH5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Cxcl11Q9JHH5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Cxcl11Q9JHH5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Cxcl11Q9JHH5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Cxcl11Q9JHH5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Cxcl11Q9JHH5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Cxcl11Q9JHH5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Cxcl11Q9JHH5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31,05■■■□□ 2,56
Cxcl11Q9JHH5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31,05■■■□□ 2,56
Cxcl11Q9JHH5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Cxcl11Q9JHH5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Cxcl11Q9JHH5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Cxcl11Q9JHH5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Cxcl11Q9JHH5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Cxcl11Q9JHH5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Cxcl11Q9JHH5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Cxcl11Q9JHH5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Cxcl11Q9JHH5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30,92■■■□□ 2,54
Cxcl11Q9JHH5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30,92■■■□□ 2,54
Cxcl11Q9JHH5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Cxcl11Q9JHH5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Cxcl11Q9JHH5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Cxcl11Q9JHH5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Cxcl11Q9JHH5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Cxcl11Q9JHH5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30,86■■■□□ 2,53
Cxcl11Q9JHH5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Cxcl11Q9JHH5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Cxcl11Q9JHH5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Cxcl11Q9JHH5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30,83■■■□□ 2,53
Cxcl11Q9JHH5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Cxcl11Q9JHH5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30,81■■■□□ 2,52
Cxcl11Q9JHH5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Cxcl11Q9JHH5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Cxcl11Q9JHH5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30,8■■■□□ 2,52
Cxcl11Q9JHH5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Cxcl11Q9JHH5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Cxcl11Q9JHH5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30,78■■■□□ 2,52
Cxcl11Q9JHH5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Cxcl11Q9JHH5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Cxcl11Q9JHH5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Cxcl11Q9JHH5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Cxcl11Q9JHH5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Cxcl11Q9JHH5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,76■■■□□ 2,51
Cxcl11Q9JHH5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Cxcl11Q9JHH5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Cxcl11Q9JHH5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Cxcl11Q9JHH5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Cxcl11Q9JHH5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Cxcl11Q9JHH5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Cxcl11Q9JHH5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,64■■■□□ 2,5
Cxcl11Q9JHH5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Cxcl11Q9JHH5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Cxcl11Q9JHH5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Cxcl11Q9JHH5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30,58■■■□□ 2,49
Cxcl11Q9JHH5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Cxcl11Q9JHH5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Cxcl11Q9JHH5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Cxcl11Q9JHH5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Cxcl11Q9JHH5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Cxcl11Q9JHH5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Cxcl11Q9JHH5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Cxcl11Q9JHH5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Cxcl11Q9JHH5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Cxcl11Q9JHH5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
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