Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Erg28Q9ERY9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Erg28Q9ERY9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Erg28Q9ERY9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Erg28Q9ERY9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Erg28Q9ERY9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Erg28Q9ERY9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Erg28Q9ERY9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Erg28Q9ERY9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Erg28Q9ERY9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Erg28Q9ERY9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Erg28Q9ERY9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Erg28Q9ERY9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Erg28Q9ERY9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Erg28Q9ERY9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Erg28Q9ERY9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Erg28Q9ERY9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Erg28Q9ERY9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Erg28Q9ERY9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Erg28Q9ERY9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Erg28Q9ERY9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Erg28Q9ERY9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Erg28Q9ERY9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Erg28Q9ERY9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Erg28Q9ERY9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Erg28Q9ERY9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Erg28Q9ERY9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Erg28Q9ERY9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Erg28Q9ERY9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Erg28Q9ERY9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Erg28Q9ERY9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Erg28Q9ERY9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Erg28Q9ERY9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Erg28Q9ERY9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Erg28Q9ERY9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Erg28Q9ERY9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Erg28Q9ERY9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Erg28Q9ERY9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Erg28Q9ERY9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Erg28Q9ERY9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Erg28Q9ERY9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Erg28Q9ERY9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Erg28Q9ERY9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Erg28Q9ERY9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Erg28Q9ERY9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Erg28Q9ERY9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Erg28Q9ERY9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Erg28Q9ERY9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erg28Q9ERY9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erg28Q9ERY9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erg28Q9ERY9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erg28Q9ERY9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Erg28Q9ERY9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Erg28Q9ERY9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Erg28Q9ERY9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Erg28Q9ERY9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Erg28Q9ERY9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Erg28Q9ERY9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Erg28Q9ERY9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Erg28Q9ERY9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Erg28Q9ERY9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Erg28Q9ERY9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Erg28Q9ERY9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Erg28Q9ERY9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Erg28Q9ERY9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Erg28Q9ERY9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Erg28Q9ERY9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Erg28Q9ERY9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Erg28Q9ERY9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Erg28Q9ERY9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Erg28Q9ERY9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Erg28Q9ERY9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Erg28Q9ERY9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Erg28Q9ERY9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Erg28Q9ERY9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Erg28Q9ERY9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Erg28Q9ERY9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Erg28Q9ERY9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Erg28Q9ERY9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Erg28Q9ERY9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Erg28Q9ERY9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms