Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dap3Q9ER88 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dap3Q9ER88 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dap3Q9ER88 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dap3Q9ER88 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dap3Q9ER88 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dap3Q9ER88 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dap3Q9ER88 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dap3Q9ER88 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Dap3Q9ER88 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dap3Q9ER88 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dap3Q9ER88 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dap3Q9ER88 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dap3Q9ER88 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dap3Q9ER88 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dap3Q9ER88 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dap3Q9ER88 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dap3Q9ER88 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dap3Q9ER88 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dap3Q9ER88 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dap3Q9ER88 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dap3Q9ER88 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dap3Q9ER88 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dap3Q9ER88 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dap3Q9ER88 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dap3Q9ER88 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dap3Q9ER88 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dap3Q9ER88 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dap3Q9ER88 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dap3Q9ER88 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dap3Q9ER88 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dap3Q9ER88 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dap3Q9ER88 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dap3Q9ER88 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dap3Q9ER88 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dap3Q9ER88 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dap3Q9ER88 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Dap3Q9ER88 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
Dap3Q9ER88 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Dap3Q9ER88 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dap3Q9ER88 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dap3Q9ER88 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dap3Q9ER88 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dap3Q9ER88 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dap3Q9ER88 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dap3Q9ER88 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dap3Q9ER88 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dap3Q9ER88 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dap3Q9ER88 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dap3Q9ER88 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dap3Q9ER88 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dap3Q9ER88 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dap3Q9ER88 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dap3Q9ER88 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dap3Q9ER88 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dap3Q9ER88 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dap3Q9ER88 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dap3Q9ER88 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dap3Q9ER88 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dap3Q9ER88 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dap3Q9ER88 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dap3Q9ER88 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dap3Q9ER88 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dap3Q9ER88 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dap3Q9ER88 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dap3Q9ER88 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Dap3Q9ER88 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dap3Q9ER88 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Dap3Q9ER88 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dap3Q9ER88 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dap3Q9ER88 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dap3Q9ER88 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dap3Q9ER88 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dap3Q9ER88 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dap3Q9ER88 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dap3Q9ER88 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dap3Q9ER88 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dap3Q9ER88 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dap3Q9ER88 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dap3Q9ER88 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dap3Q9ER88 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dap3Q9ER88 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dap3Q9ER88 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dap3Q9ER88 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dap3Q9ER88 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dap3Q9ER88 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Dap3Q9ER88 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dap3Q9ER88 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dap3Q9ER88 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dap3Q9ER88 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dap3Q9ER88 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dap3Q9ER88 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Dap3Q9ER88 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dap3Q9ER88 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dap3Q9ER88 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dap3Q9ER88 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dap3Q9ER88 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dap3Q9ER88 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dap3Q9ER88 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dap3Q9ER88 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms