Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ap3s1Q9DCR2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ap3s1Q9DCR2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ap3s1Q9DCR2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ap3s1Q9DCR2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ap3s1Q9DCR2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ap3s1Q9DCR2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ap3s1Q9DCR2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Ap3s1Q9DCR2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ap3s1Q9DCR2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ap3s1Q9DCR2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Ap3s1Q9DCR2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ap3s1Q9DCR2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ap3s1Q9DCR2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ap3s1Q9DCR2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ap3s1Q9DCR2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ap3s1Q9DCR2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ap3s1Q9DCR2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ap3s1Q9DCR2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ap3s1Q9DCR2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ap3s1Q9DCR2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ap3s1Q9DCR2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22,93■■□□□ 1,26
Ap3s1Q9DCR2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ap3s1Q9DCR2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ap3s1Q9DCR2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ap3s1Q9DCR2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ap3s1Q9DCR2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ap3s1Q9DCR2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ap3s1Q9DCR2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Ap3s1Q9DCR2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Ap3s1Q9DCR2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,89■■□□□ 1,25
Ap3s1Q9DCR2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ap3s1Q9DCR2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ap3s1Q9DCR2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Ap3s1Q9DCR2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Ap3s1Q9DCR2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Ap3s1Q9DCR2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Ap3s1Q9DCR2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Ap3s1Q9DCR2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Ap3s1Q9DCR2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Ap3s1Q9DCR2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ap3s1Q9DCR2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ap3s1Q9DCR2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ap3s1Q9DCR2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Ap3s1Q9DCR2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Ap3s1Q9DCR2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22,75■■□□□ 1,23
Ap3s1Q9DCR2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Ap3s1Q9DCR2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,73■■□□□ 1,23
Ap3s1Q9DCR2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,71■■□□□ 1,23
Ap3s1Q9DCR2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Ap3s1Q9DCR2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Ap3s1Q9DCR2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Ap3s1Q9DCR2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Ap3s1Q9DCR2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Ap3s1Q9DCR2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Ap3s1Q9DCR2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Ap3s1Q9DCR2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,64■■□□□ 1,22
Ap3s1Q9DCR2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Ap3s1Q9DCR2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22,63■■□□□ 1,21
Ap3s1Q9DCR2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Ap3s1Q9DCR2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Ap3s1Q9DCR2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Ap3s1Q9DCR2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,6■■□□□ 1,21
Ap3s1Q9DCR2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,59■■□□□ 1,21
Ap3s1Q9DCR2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Ap3s1Q9DCR2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22,59■■□□□ 1,21
Ap3s1Q9DCR2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Ap3s1Q9DCR2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,57■■□□□ 1,2
Ap3s1Q9DCR2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Ap3s1Q9DCR2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Ap3s1Q9DCR2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Ap3s1Q9DCR2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Ap3s1Q9DCR2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22,54■■□□□ 1,2
Ap3s1Q9DCR2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Ap3s1Q9DCR2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,54■■□□□ 1,2
Ap3s1Q9DCR2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Ap3s1Q9DCR2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Ap3s1Q9DCR2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,53■■□□□ 1,2
Ap3s1Q9DCR2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Ap3s1Q9DCR2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Ap3s1Q9DCR2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Ap3s1Q9DCR2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Ap3s1Q9DCR2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Ap3s1Q9DCR2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Ap3s1Q9DCR2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Ap3s1Q9DCR2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Ap3s1Q9DCR2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22,5■■□□□ 1,19
Ap3s1Q9DCR2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Ap3s1Q9DCR2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Ap3s1Q9DCR2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Ap3s1Q9DCR2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Ap3s1Q9DCR2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Ap3s1Q9DCR2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,45■■□□□ 1,18
Ap3s1Q9DCR2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Ap3s1Q9DCR2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22,43■■□□□ 1,18
Ap3s1Q9DCR2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Ap3s1Q9DCR2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Ap3s1Q9DCR2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Ap3s1Q9DCR2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Ap3s1Q9DCR2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,8 ms