Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Calr3Q9D9Q6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Calr3Q9D9Q6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Calr3Q9D9Q6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Calr3Q9D9Q6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Calr3Q9D9Q6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Calr3Q9D9Q6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Calr3Q9D9Q6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Calr3Q9D9Q6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Calr3Q9D9Q6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Calr3Q9D9Q6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Calr3Q9D9Q6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Calr3Q9D9Q6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Calr3Q9D9Q6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Calr3Q9D9Q6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Calr3Q9D9Q6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Calr3Q9D9Q6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Calr3Q9D9Q6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Calr3Q9D9Q6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Calr3Q9D9Q6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Calr3Q9D9Q6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Calr3Q9D9Q6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Calr3Q9D9Q6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Calr3Q9D9Q6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Calr3Q9D9Q6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Calr3Q9D9Q6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Calr3Q9D9Q6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Calr3Q9D9Q6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Calr3Q9D9Q6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Calr3Q9D9Q6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Calr3Q9D9Q6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Calr3Q9D9Q6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Calr3Q9D9Q6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Calr3Q9D9Q6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Calr3Q9D9Q6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Calr3Q9D9Q6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calr3Q9D9Q6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calr3Q9D9Q6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calr3Q9D9Q6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calr3Q9D9Q6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Calr3Q9D9Q6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Calr3Q9D9Q6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Calr3Q9D9Q6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calr3Q9D9Q6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calr3Q9D9Q6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Calr3Q9D9Q6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Calr3Q9D9Q6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Calr3Q9D9Q6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Calr3Q9D9Q6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Calr3Q9D9Q6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Calr3Q9D9Q6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Calr3Q9D9Q6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Calr3Q9D9Q6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Calr3Q9D9Q6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Calr3Q9D9Q6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Calr3Q9D9Q6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Calr3Q9D9Q6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Calr3Q9D9Q6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Calr3Q9D9Q6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Calr3Q9D9Q6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calr3Q9D9Q6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calr3Q9D9Q6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Calr3Q9D9Q6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Calr3Q9D9Q6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Calr3Q9D9Q6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Calr3Q9D9Q6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Calr3Q9D9Q6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Calr3Q9D9Q6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Calr3Q9D9Q6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Calr3Q9D9Q6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Calr3Q9D9Q6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Calr3Q9D9Q6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Calr3Q9D9Q6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Calr3Q9D9Q6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Calr3Q9D9Q6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Calr3Q9D9Q6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Calr3Q9D9Q6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Calr3Q9D9Q6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Calr3Q9D9Q6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Calr3Q9D9Q6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Calr3Q9D9Q6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Calr3Q9D9Q6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Calr3Q9D9Q6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Calr3Q9D9Q6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Calr3Q9D9Q6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Calr3Q9D9Q6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Calr3Q9D9Q6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Calr3Q9D9Q6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Calr3Q9D9Q6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Calr3Q9D9Q6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calr3Q9D9Q6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calr3Q9D9Q6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calr3Q9D9Q6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calr3Q9D9Q6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Calr3Q9D9Q6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Calr3Q9D9Q6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Calr3Q9D9Q6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Calr3Q9D9Q6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Calr3Q9D9Q6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Calr3Q9D9Q6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms