Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TcimQ9D915 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TcimQ9D915 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TcimQ9D915 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TcimQ9D915 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TcimQ9D915 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TcimQ9D915 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TcimQ9D915 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TcimQ9D915 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TcimQ9D915 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TcimQ9D915 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TcimQ9D915 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TcimQ9D915 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TcimQ9D915 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TcimQ9D915 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TcimQ9D915 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TcimQ9D915 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TcimQ9D915 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TcimQ9D915 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TcimQ9D915 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TcimQ9D915 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TcimQ9D915 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TcimQ9D915 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TcimQ9D915 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TcimQ9D915 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TcimQ9D915 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TcimQ9D915 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TcimQ9D915 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TcimQ9D915 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TcimQ9D915 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TcimQ9D915 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TcimQ9D915 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TcimQ9D915 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TcimQ9D915 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TcimQ9D915 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TcimQ9D915 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TcimQ9D915 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TcimQ9D915 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TcimQ9D915 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TcimQ9D915 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TcimQ9D915 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TcimQ9D915 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TcimQ9D915 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TcimQ9D915 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TcimQ9D915 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TcimQ9D915 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TcimQ9D915 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TcimQ9D915 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TcimQ9D915 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TcimQ9D915 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TcimQ9D915 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TcimQ9D915 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TcimQ9D915 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TcimQ9D915 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TcimQ9D915 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TcimQ9D915 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TcimQ9D915 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TcimQ9D915 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TcimQ9D915 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TcimQ9D915 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TcimQ9D915 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TcimQ9D915 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TcimQ9D915 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TcimQ9D915 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TcimQ9D915 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TcimQ9D915 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TcimQ9D915 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TcimQ9D915 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TcimQ9D915 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TcimQ9D915 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TcimQ9D915 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TcimQ9D915 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TcimQ9D915 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TcimQ9D915 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TcimQ9D915 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TcimQ9D915 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TcimQ9D915 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TcimQ9D915 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TcimQ9D915 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TcimQ9D915 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TcimQ9D915 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TcimQ9D915 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TcimQ9D915 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TcimQ9D915 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TcimQ9D915 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TcimQ9D915 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TcimQ9D915 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TcimQ9D915 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TcimQ9D915 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TcimQ9D915 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TcimQ9D915 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TcimQ9D915 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TcimQ9D915 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TcimQ9D915 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TcimQ9D915 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TcimQ9D915 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TcimQ9D915 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TcimQ9D915 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TcimQ9D915 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TcimQ9D915 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms