Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2e2Q9D902 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2e2Q9D902 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2e2Q9D902 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2e2Q9D902 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2e2Q9D902 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2e2Q9D902 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2e2Q9D902 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2e2Q9D902 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2e2Q9D902 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2e2Q9D902 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e2Q9D902 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e2Q9D902 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2e2Q9D902 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2e2Q9D902 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2e2Q9D902 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2e2Q9D902 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2e2Q9D902 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2e2Q9D902 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2e2Q9D902 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2e2Q9D902 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2e2Q9D902 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2e2Q9D902 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2e2Q9D902 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2e2Q9D902 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2e2Q9D902 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2e2Q9D902 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Gtf2e2Q9D902 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2e2Q9D902 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2e2Q9D902 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2e2Q9D902 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2e2Q9D902 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2e2Q9D902 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2e2Q9D902 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2e2Q9D902 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2e2Q9D902 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2e2Q9D902 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2e2Q9D902 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2e2Q9D902 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2e2Q9D902 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2e2Q9D902 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2e2Q9D902 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2e2Q9D902 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gtf2e2Q9D902 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2e2Q9D902 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2e2Q9D902 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2e2Q9D902 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2e2Q9D902 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2e2Q9D902 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2e2Q9D902 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2e2Q9D902 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2e2Q9D902 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2e2Q9D902 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2e2Q9D902 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2e2Q9D902 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2e2Q9D902 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2e2Q9D902 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2e2Q9D902 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2e2Q9D902 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2e2Q9D902 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e2Q9D902 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e2Q9D902 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e2Q9D902 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2e2Q9D902 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2e2Q9D902 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2e2Q9D902 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e2Q9D902 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e2Q9D902 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e2Q9D902 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2e2Q9D902 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2e2Q9D902 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2e2Q9D902 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2e2Q9D902 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2e2Q9D902 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2e2Q9D902 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2e2Q9D902 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2e2Q9D902 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e2Q9D902 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2e2Q9D902 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2e2Q9D902 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2e2Q9D902 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2e2Q9D902 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf2e2Q9D902 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf2e2Q9D902 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2e2Q9D902 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2e2Q9D902 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2e2Q9D902 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2e2Q9D902 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2e2Q9D902 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2e2Q9D902 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2e2Q9D902 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2e2Q9D902 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2e2Q9D902 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2e2Q9D902 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2e2Q9D902 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2e2Q9D902 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2e2Q9D902 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2e2Q9D902 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2e2Q9D902 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2e2Q9D902 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms