Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rexo2Q9D8S4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rexo2Q9D8S4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rexo2Q9D8S4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rexo2Q9D8S4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rexo2Q9D8S4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rexo2Q9D8S4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rexo2Q9D8S4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rexo2Q9D8S4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rexo2Q9D8S4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rexo2Q9D8S4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rexo2Q9D8S4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rexo2Q9D8S4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rexo2Q9D8S4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rexo2Q9D8S4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rexo2Q9D8S4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rexo2Q9D8S4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rexo2Q9D8S4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rexo2Q9D8S4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rexo2Q9D8S4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rexo2Q9D8S4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rexo2Q9D8S4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rexo2Q9D8S4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rexo2Q9D8S4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rexo2Q9D8S4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rexo2Q9D8S4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rexo2Q9D8S4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rexo2Q9D8S4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rexo2Q9D8S4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rexo2Q9D8S4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rexo2Q9D8S4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rexo2Q9D8S4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rexo2Q9D8S4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rexo2Q9D8S4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rexo2Q9D8S4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rexo2Q9D8S4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rexo2Q9D8S4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rexo2Q9D8S4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rexo2Q9D8S4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rexo2Q9D8S4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rexo2Q9D8S4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rexo2Q9D8S4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rexo2Q9D8S4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rexo2Q9D8S4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rexo2Q9D8S4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rexo2Q9D8S4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rexo2Q9D8S4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Rexo2Q9D8S4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rexo2Q9D8S4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rexo2Q9D8S4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rexo2Q9D8S4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rexo2Q9D8S4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rexo2Q9D8S4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rexo2Q9D8S4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rexo2Q9D8S4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rexo2Q9D8S4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rexo2Q9D8S4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rexo2Q9D8S4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rexo2Q9D8S4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rexo2Q9D8S4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rexo2Q9D8S4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rexo2Q9D8S4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rexo2Q9D8S4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rexo2Q9D8S4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rexo2Q9D8S4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rexo2Q9D8S4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rexo2Q9D8S4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rexo2Q9D8S4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rexo2Q9D8S4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rexo2Q9D8S4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rexo2Q9D8S4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rexo2Q9D8S4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rexo2Q9D8S4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rexo2Q9D8S4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rexo2Q9D8S4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rexo2Q9D8S4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rexo2Q9D8S4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rexo2Q9D8S4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rexo2Q9D8S4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rexo2Q9D8S4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rexo2Q9D8S4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rexo2Q9D8S4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rexo2Q9D8S4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rexo2Q9D8S4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rexo2Q9D8S4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rexo2Q9D8S4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rexo2Q9D8S4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rexo2Q9D8S4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rexo2Q9D8S4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rexo2Q9D8S4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rexo2Q9D8S4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rexo2Q9D8S4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rexo2Q9D8S4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rexo2Q9D8S4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rexo2Q9D8S4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rexo2Q9D8S4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rexo2Q9D8S4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rexo2Q9D8S4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms