Protein–RNA interactions for Protein: Q9D809

2200002D01Rik, MCG22941, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2200002D01RikQ9D809 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
2200002D01RikQ9D809 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
2200002D01RikQ9D809 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2200002D01RikQ9D809 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2200002D01RikQ9D809 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2200002D01RikQ9D809 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2200002D01RikQ9D809 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
2200002D01RikQ9D809 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
2200002D01RikQ9D809 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
2200002D01RikQ9D809 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
2200002D01RikQ9D809 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
2200002D01RikQ9D809 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
2200002D01RikQ9D809 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
2200002D01RikQ9D809 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
2200002D01RikQ9D809 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
2200002D01RikQ9D809 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
2200002D01RikQ9D809 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
2200002D01RikQ9D809 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
2200002D01RikQ9D809 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
2200002D01RikQ9D809 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
2200002D01RikQ9D809 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
2200002D01RikQ9D809 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
2200002D01RikQ9D809 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
2200002D01RikQ9D809 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2200002D01RikQ9D809 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2200002D01RikQ9D809 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
2200002D01RikQ9D809 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
2200002D01RikQ9D809 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
2200002D01RikQ9D809 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
2200002D01RikQ9D809 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
2200002D01RikQ9D809 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
2200002D01RikQ9D809 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2200002D01RikQ9D809 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
2200002D01RikQ9D809 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
2200002D01RikQ9D809 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
2200002D01RikQ9D809 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
2200002D01RikQ9D809 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
2200002D01RikQ9D809 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
2200002D01RikQ9D809 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2200002D01RikQ9D809 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
2200002D01RikQ9D809 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
2200002D01RikQ9D809 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
2200002D01RikQ9D809 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2200002D01RikQ9D809 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2200002D01RikQ9D809 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
2200002D01RikQ9D809 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
2200002D01RikQ9D809 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2200002D01RikQ9D809 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2200002D01RikQ9D809 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2200002D01RikQ9D809 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
2200002D01RikQ9D809 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
2200002D01RikQ9D809 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
2200002D01RikQ9D809 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
2200002D01RikQ9D809 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
2200002D01RikQ9D809 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
2200002D01RikQ9D809 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
2200002D01RikQ9D809 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
2200002D01RikQ9D809 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
2200002D01RikQ9D809 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
2200002D01RikQ9D809 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
2200002D01RikQ9D809 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
2200002D01RikQ9D809 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
2200002D01RikQ9D809 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
2200002D01RikQ9D809 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
2200002D01RikQ9D809 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
2200002D01RikQ9D809 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
2200002D01RikQ9D809 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
2200002D01RikQ9D809 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
2200002D01RikQ9D809 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
2200002D01RikQ9D809 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
2200002D01RikQ9D809 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
2200002D01RikQ9D809 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
2200002D01RikQ9D809 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
2200002D01RikQ9D809 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
2200002D01RikQ9D809 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
2200002D01RikQ9D809 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
2200002D01RikQ9D809 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
2200002D01RikQ9D809 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
2200002D01RikQ9D809 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
2200002D01RikQ9D809 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
2200002D01RikQ9D809 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
2200002D01RikQ9D809 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
2200002D01RikQ9D809 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
2200002D01RikQ9D809 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
2200002D01RikQ9D809 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
2200002D01RikQ9D809 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
2200002D01RikQ9D809 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
2200002D01RikQ9D809 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
2200002D01RikQ9D809 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
2200002D01RikQ9D809 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
2200002D01RikQ9D809 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
2200002D01RikQ9D809 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
2200002D01RikQ9D809 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
2200002D01RikQ9D809 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
2200002D01RikQ9D809 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
2200002D01RikQ9D809 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
2200002D01RikQ9D809 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
2200002D01RikQ9D809 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
2200002D01RikQ9D809 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
2200002D01RikQ9D809 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms